قسم الهندسة المدنية هو أحد الأقسام الذي تم إنشاؤه من ضمن أربعة أقسام لكلية الهندسة والتقنية في العام 1993م وذلك بعد أن شكَلت الأخيرة مع كلية التربية جامعة وادي النيل. ويشرف القسم الآن علي برنامج بكلاريوس الشرف في الهندسة المدنية في خمس سنوات، وبرنامج دبلوم الهندسة المدنية في ثلاث سنوات. بالقسم خمس شعب، شعبة هندسة التربة، شعبة هندسة المساحة والطرق،شعبة هندسة المياه والصحية، شعبة هندسة الإنشاءات وشعبة هندسة التشييد. كما يضم القسم عدد من المعامل والورش،معمل التربة،معمل المواد، معمل المساحة، ورشة المباني،ورشة السباكة،ورشة النجارة.

أهداف القسم:

إعداد مهندسين مدنيين أكفاء يقومون بالإشراف (تصميم وتنفيذ) على مشاريع التنمية العمرانية بالبلاد، على الصعيدين، القطاع العام والقطاع الخاص.
التعاون مع مؤسسات التعليم العالي في كل مجالات العملية التعليمية وتطوير البحث العلمي في حقل الهندسة المدنية.
الإشراف على برامج للدراسات العليا، ماجستير ودكتوراة، في حقل الهندسة المدنية.
عمل دورات تدريبية لمهندسي الولاية وآخرين لمواكبة المستجدات وعلى برامج الحاسوب الهندسية المتخصصة.
المشاركة في التخطيط والإشراف على مشاريع التنمية بالولاية خاصةً والسودان عامةً، وذلك من خلال الهيئة الاستشارية للجامعة وبالتعاون مع الجهات ذات الصلة.
تقديم الخدمات الاستشارية من تصميم وإجراء التجارب المعملية المطلوبة في مجال التشييد لبعض الأفراد والشركات العاملة بالولاية.
الورش والمختبرات:

يضم قسم الهندسة المدنية المختبرات والورش الآتية:

مختبر التربة
مختبر الخرسانة والاسمنت
مختبر الطرق
مختبر المساحة
ورشة النجارة
ورشة المباني.